Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RAPGEF2Q9Y4G8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
RAPGEF2Q9Y4G8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RAPGEF2Q9Y4G8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
RAPGEF2Q9Y4G8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RAPGEF2Q9Y4G8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC42.63■■■■■ 4.42
RAPGEF2Q9Y4G8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RAPGEF2Q9Y4G8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RAPGEF2Q9Y4G8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms