Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NRXN3Q9Y4C0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NRXN3Q9Y4C0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NRXN3Q9Y4C0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NRXN3Q9Y4C0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NRXN3Q9Y4C0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NRXN3Q9Y4C0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NRXN3Q9Y4C0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms