Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.14■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC51.13■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC51.13■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC51.11■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC51.09■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.09■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
DCAF1Q9Y4B6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC51.02■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.76
DCAF1Q9Y4B6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51■■■■■ 5.75
DCAF1Q9Y4B6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC51■■■■■ 5.75
DCAF1Q9Y4B6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
DCAF1Q9Y4B6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
DCAF1Q9Y4B6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.96■■■■■ 5.75
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
DCAF1Q9Y4B6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.91■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC50.9■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC50.9■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
DCAF1Q9Y4B6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
DCAF1Q9Y4B6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
DCAF1Q9Y4B6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
DCAF1Q9Y4B6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
DCAF1Q9Y4B6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
DCAF1Q9Y4B6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
DCAF1Q9Y4B6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
DCAF1Q9Y4B6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
DCAF1Q9Y4B6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.74■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC50.73■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC50.72■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC50.69■■■■■ 5.71
DCAF1Q9Y4B6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.67■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC50.66■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.65■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
DCAF1Q9Y4B6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC50.63■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC50.61■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.61■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC50.58■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC50.58■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
DCAF1Q9Y4B6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC50.56■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC50.52■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
DCAF1Q9Y4B6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC50.5■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC50.49■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.49■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms