Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKAB1Q9Y478 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAB1Q9Y478 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAB1Q9Y478 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms