Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIP1Q9Y3R0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GRIP1Q9Y3R0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIP1Q9Y3R0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIP1Q9Y3R0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms