Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL3Q9Y3E1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms