Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX4Q9Y2E6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX4Q9Y2E6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX4Q9Y2E6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX4Q9Y2E6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX4Q9Y2E6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms