Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRRM2Q9UQ35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRM2Q9UQ35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM2Q9UQ35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms