Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAF8Q9UPN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAF8Q9UPN6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAF8Q9UPN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAF8Q9UPN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCAF8Q9UPN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCAF8Q9UPN6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCAF8Q9UPN6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCAF8Q9UPN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCAF8Q9UPN6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCAF8Q9UPN6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCAF8Q9UPN6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SCAF8Q9UPN6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCAF8Q9UPN6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAF8Q9UPN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAF8Q9UPN6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAF8Q9UPN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms