Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR3Q9UNL2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR3Q9UNL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR3Q9UNL2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms