Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCML1Q9UN30 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCML1Q9UN30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCML1Q9UN30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCML1Q9UN30 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCML1Q9UN30 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCML1Q9UN30 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms