Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPCAL4Q9UM19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HPCAL4Q9UM19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPCAL4Q9UM19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms