Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCC3Q9ULS5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCC3Q9ULS5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCC3Q9ULS5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCC3Q9ULS5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms