Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MED23Q9ULK4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MED23Q9ULK4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MED23Q9ULK4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MED23Q9ULK4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MED23Q9ULK4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MED23Q9ULK4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MED23Q9ULK4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MED23Q9ULK4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MED23Q9ULK4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MED23Q9ULK4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MED23Q9ULK4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MED23Q9ULK4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MED23Q9ULK4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms