Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3Q9UKS6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3Q9UKS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3Q9UKS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3Q9UKS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms