Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP5Q9UJQ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP5Q9UJQ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms