Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPN3Q9UHW5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPN3Q9UHW5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPN3Q9UHW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPN3Q9UHW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms