Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCSK1NQ9UHG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCSK1NQ9UHG2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCSK1NQ9UHG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCSK1NQ9UHG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCSK1NQ9UHG2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCSK1NQ9UHG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCSK1NQ9UHG2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCSK1NQ9UHG2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCSK1NQ9UHG2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCSK1NQ9UHG2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms