Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFT172Q9UG01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IFT172Q9UG01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT172Q9UG01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
IFT172Q9UG01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT172Q9UG01 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
IFT172Q9UG01 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
IFT172Q9UG01 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms