Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RIMBP3Q9UFD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RIMBP3Q9UFD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
RIMBP3Q9UFD9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
RIMBP3Q9UFD9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
RIMBP3Q9UFD9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RIMBP3Q9UFD9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
RIMBP3Q9UFD9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3Q9UFD9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3Q9UFD9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.92■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RIMBP3Q9UFD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RIMBP3Q9UFD9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RIMBP3Q9UFD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RIMBP3Q9UFD9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
RIMBP3Q9UFD9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RIMBP3Q9UFD9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RIMBP3Q9UFD9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
RIMBP3Q9UFD9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
RIMBP3Q9UFD9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RIMBP3Q9UFD9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
RIMBP3Q9UFD9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
RIMBP3Q9UFD9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
RIMBP3Q9UFD9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RIMBP3Q9UFD9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
RIMBP3Q9UFD9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms