Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NXF1Q9UBU9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NXF1Q9UBU9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NXF1Q9UBU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF1Q9UBU9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NXF1Q9UBU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms