Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKLFQ9UBR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKLFQ9UBR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKLFQ9UBR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms