Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMMD3Q9UBI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3Q9UBI1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD3Q9UBI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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