Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF7Q9UBF6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF7Q9UBF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF7Q9UBF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF7Q9UBF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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