Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC17A6Q9P2U8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC17A6Q9P2U8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC17A6Q9P2U8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC17A6Q9P2U8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms