Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR35Q9P2L0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR35Q9P2L0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR35Q9P2L0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR35Q9P2L0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR35Q9P2L0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms