Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC88CQ9P219 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC88CQ9P219 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC88CQ9P219 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC88CQ9P219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC88CQ9P219 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms