Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRN3Q9NYV6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRN3Q9NYV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRN3Q9NYV6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRN3Q9NYV6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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