Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COA4Q9NYJ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COA4Q9NYJ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COA4Q9NYJ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COA4Q9NYJ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COA4Q9NYJ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms