Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INTS9Q9NV88 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INTS9Q9NV88 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INTS9Q9NV88 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INTS9Q9NV88 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms