Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCMTD2Q9NV79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD2Q9NV79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD2Q9NV79 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms