Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACER3Q9NUN7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACER3Q9NUN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACER3Q9NUN7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACER3Q9NUN7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms