Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
RRP7BPQ9NSQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RRP7BPQ9NSQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRP7BPQ9NSQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms