Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT82Q9NSB4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT82Q9NSB4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT82Q9NSB4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT82Q9NSB4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT82Q9NSB4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT82Q9NSB4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms