Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKN1Q9NS71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GKN1Q9NS71 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GKN1Q9NS71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKN1Q9NS71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms