Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERINC1Q9NRX5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC1Q9NRX5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC1Q9NRX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERINC1Q9NRX5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERINC1Q9NRX5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms