Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHAF3Q9NRP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF3Q9NRP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF3Q9NRP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms