Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRN4Q9NRL3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
STRN4Q9NRL3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
STRN4Q9NRL3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
STRN4Q9NRL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRN4Q9NRL3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
STRN4Q9NRL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
STRN4Q9NRL3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms