Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLE3Q9NRF9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLE3Q9NRF9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLE3Q9NRF9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLE3Q9NRF9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms