Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DLL4Q9NR61 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL4Q9NR61 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL4Q9NR61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL4Q9NR61 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL4Q9NR61 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms