Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf4Q9NR00 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf4Q9NR00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C8orf4Q9NR00 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C8orf4Q9NR00 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms