Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf4Q9NQ89 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf4Q9NQ89 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C12orf4Q9NQ89 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms