Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NGRNQ9NPE2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NGRNQ9NPE2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NGRNQ9NPE2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NGRNQ9NPE2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NGRNQ9NPE2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms