Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCM1Q9NP62 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM1Q9NP62 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCM1Q9NP62 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCM1Q9NP62 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCM1Q9NP62 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCM1Q9NP62 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCM1Q9NP62 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms