Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNA4Q9HCM2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA4Q9HCM2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNA4Q9HCM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PLXNA4Q9HCM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNA4Q9HCM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms