Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF1Q9HCE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF1Q9HCE7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMURF1Q9HCE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms