Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4Q9HBW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4Q9HBW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC4Q9HBW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC4Q9HBW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4Q9HBW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4Q9HBW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 744 ms