Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC52A2Q9HAB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC52A2Q9HAB3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC52A2Q9HAB3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SLC52A2Q9HAB3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SLC52A2Q9HAB3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SLC52A2Q9HAB3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A2Q9HAB3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A2Q9HAB3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC52A2Q9HAB3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SLC52A2Q9HAB3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A2Q9HAB3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC52A2Q9HAB3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms