Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG4Q9H9E3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG4Q9H9E3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG4Q9H9E3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG4Q9H9E3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 554.3 ms