Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2LQ9H987 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2LQ9H987 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNPO2LQ9H987 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNPO2LQ9H987 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNPO2LQ9H987 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms